Vinnicos kraštotyros muziejus buvo įkurtas 1918 m. gegužę remiantis gamtos, etnografiniais, istoriniais Žemstvo apskrities, Podolsko žemės ūkio draugijos kolekcijomis ir privačiomis Istorijos paminklų apsaugos draugijos narių kolekcijomis. Nuo 1929 m. jis užima vieną iš buvusio jėzuitų vienuolyno patalpų, priklausančių Mura istoriniam ir architektūriniam kompleksui. 1944 metais naciai iš muziejaus išvežė per 6000 vertingų daiktų – beveik pusę ekspozicijos – daugiausia daiktų iš etnografinių, archeologijos ir numizmatikos kolekcijų.

Pokario metais įvyko keletas muziejaus rekonstrukcijų. Dabar jos 20 salių, kurių bendras plotas viršija 2000 kvadratinių metrų, eksponuojama daugiau nei 100 000 dirbinių, tarp kurių – unikali bronzos ir sarmatijos laikų auksinių papuošalų kolekcija. Muziejuje yra biblioteka, kurioje yra 11 000 XVIII pabaigos – ankstyvųjų leidimų. XXI amžius. Tame pačiame kieme su kraštotyros muziejumi yra Vinicos meno muziejus. Taip pat yra bronzinis paminklas jaunam Tarasui Ševčenkai.